Eine wichtige Tätigkeit im Rahmen der ECPGR-Kooperation ist die Umsetzung und Weiterentwicklung des Europäischen Internet-Suchkatalogs zu pflanzengenetischen Ressourcen (European Search Catalogue - EURISCO). EURISCO liefert Informationen über Ex-situ-Genbanksammlungen in ganz Europa. Er umfasst derzeit Passportdaten von über 2 Millionen Muster pflanzengenetischer Ressourcen, die in ca. 400 europäischen Instituten in über 40 Ländern aufbewahrt werden. Die Daten des deutschen Nationalen Inventars PGRDEU werden mehrmals jährlich in EURISCO aktualisiert.

Eine weitere wichtige Aufgabe des ECPGR ist die Koordination von AEGIS (A European Genebank Integrated System), der ‚virtuellen‘ europäischen Genbank, die zum Ziel hat genetisch einzigartige (unique) und wichtige Akzessionen zu erhalten und Forschung und Züchtung zur Verfügung zu stellen. Diese Genbanksammlung wird aus europäischen Akzessionen zusammengestellt, die von den Assoziierten Mitgliedern des AEGIS-Systems im Auftrag der ECPGR-Mitgliedsstaaten erhalten werden. Europäische Akzessionen werden entsprechend den technischen Standards erhalten, die auf der Ebene des ECPGR auf den Prinzipien des AEGIS-Qualitätssystems AQUAS vereinbart sind. Sie sind gegen Unterschrift unter ein Standard-Material-Transfer-Abkommen (SMTA) erhältlich.